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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原动物群非特异朋友、寡核苷酸修饰语投资成本高额或操作步骤方案繁多。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学精英团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低生产成本、跨种类、全平台网站兼容的全新解决方案。

杂志百科

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国家实验院显性基因病与大动物学分析所和国家显性基因病协会主办人的新国际学界学术讨论刊物,努力于曝光活力实验和中医药学显性基因病学范围的创作者性分析优秀成果。JGG 2026年度损害成分7.1,Scopus学界学术讨论刊物测评指標CiteScore 9.9,跃居JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY范围Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY范围Q1区,跃居国家实验院学术讨论刊物设计布局动物学商品类别1区(Top学术讨论刊物),显性基因病学和生化学与原子动物学小类双1区。

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什么样的是HEATag

幽默的“二一体化”制定

HEATag是由凝集素和HUH内切酶包括的深度融合蛋清

「精准定位器」版块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化修饰语(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线接插件」组件 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索条状码去共价联接。

“1+1>2”的目的:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样表标记符号与追根。

Fig1: HEATag众多箭头设计原理关心图

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实战演练捡验

HEATag知乎问答有点能打?

就能够在各种不同情况下,改变哺乳期小动物血组织细胞系单血组织细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研销售团队为 HEATag 软件设置了多轮 “心理压力测验”,从生殖细胞系系到生殖细胞系核,从恒温的到环境温度,从新鲜样例到一定样例,全定位安全验证它的安稳性和正规性。

一、轮测试软件对於哺乳期绿色组织组织内部系:深入定性分析工作员取舍了来自五湖四海人、鼠、仓鼠4个鱼类的七种组织组织内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在在常温下使用 HEATag 标志后混合型喂养测序。结果回报的 11447 个组织组织内部中,85.66% 都能按照 HEATag 方形码精确性同一到原鱼类,样表间对称破坏特少,UMAP 聚类算法定性分析也会证明书,HEATag 方形码与鱼类特情人dna组特色高同一。 好了,测验状况进的一步提升:探究员工常试在 4℃下箭头符号鲜活神经组织核、在环境温度下箭头符号甲醇一定好神经组织核,甚至会随便箭头符号神经组织核核。最终还显眼:大多数状况下,模板价格标签与植物物种个人信息均有着极好的相关内容性,转换准确性率超 95%。就算甲醇一定好会导致较轻的转录本交错被污染的,神经组织核核准备产生大量 RNA 因为流失,神经组织核类行的注脚最终还与鲜活模板长期保持共同,验证 HEATag 不错箭头符号不相同正确处理状况下的科学试验模板。

Fig2: HEATag 可在不一样因素下搞定单细胞膜转录组混样数据分析

要标识哺乳期间各种部分动物和浮游生物无脊椎神经各种部分动物的原代血细胞

倘若说神经组织系测试软件是 “地基题”,那组织结构子样本量那就是 “追加题”, 等等子样本量恰巧因神经组织业务类型非常复杂、坏境顺应性异常,作为标示水平的 “重薄弱环节”,而 HEATag 恰巧在等等 “重薄弱环节” 上展露了胜机。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织安排,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这样不仅能被精确判断,那些主耍细胞系方式的聚类分析法结局都比较清楚可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海上生态学的配适性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与鱼类转录组兼有较高同步性,不会有会出现因高盐周围环境以至于的 “标记图片不能正常工作”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可保持喂乳软体动物组织结构样板众多 scRNA-seq 阐述

Fig4: HEATag可做到新的海底无脊椎骨节肢动物多大 scRNA-seq 介绍

HEATag与神经细胞的综合都不会造成转录组的特殊改变了

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在达到标识工作的互相,不懂对随后的转录酚类化合物析造电磁波辐射,可以保障了分析数值的实际性。

Fig5: HEATag不要干扰模板的 RNA 表现方式

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未来生活可期

HEATag 能为单肿瘤细胞研究方案带来了啥子?

HEATag 的价值量,远不是只有于 “克服标示的问题”,它的机灵性和普遍性,已经为单細胞深入分析开放大多概率性

从应该用消费场景分析

HEATag 能扩大从 “很简单较浅析”(如癌企业与正确企业、治疗药物净化处理与比对)到 “大企业总量钻研探讨”(如企业上皮血细胞图谱生成、高通骁龙量挑选)的全标准需要量。逐渐 PIP-seq、Stereo-cell 等复合型可初始化方法的发展进步,HEATag 还能进的一步大幅提升单上皮血细胞钻研探讨的通量,助推研发品牌团队开设不大企业总量的品牌。

从跨方面实力来

HEATag 不光适宜于转录组学,还能与表观基因组组学、蛋白酶质组学、地方组学等技木依照,经由全屋定制目录和寡核苷酸回文序列,HEATag 也行容易带入有差异 的组学工艺流程,不影响到4g信号驯服程度。同时,根据HEATag还也行發展单血细胞糖组学科学研究技木。

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协作动向

拜谱生物学与陈凯教导制定目标阶段性媒体合作意想

引起的关注的是,在 HEATag 枝术展现什么出许许多多软件APP潜质的题材下,拜谱生物制品工程公程已与我国南部海上资源科学探索与公程深圳进行标本室(汕头)陈凯传授达到目标阶段性配合的想法。当事人设计强调 HEATag 枝术的产业群化落实、教育教学科研管理还原成等走向实现纵深区域合作,确保哪一低人工成本、跨鱼类的单神经组织标识枝术速度快软件APP于真正教育教学科研管理情况,为大多进行标本室提供了提高效率、经济实惠的单神经组织探索道具,助推教育教学科研管理业务者在神经组织生物制品工程公程学、海上资源生物制品工程公程学、患病缘由等研究方向授予大多突破自我
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