
近日,沈阳医科大专业第一次附设门诊王学浩工程院院士拜谱生物在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法养分分解检测分析服务。
英文版一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕一级标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
投资者公司的:南京医科大学
探析的材料:细胞
拜谱提高服务性:转录组测序+蛋清互作组+靶向疗法激光能量细胞代谢组
技巧路径:
探析数据
01、YBX1被判定为HCC中糖酵解的关键点dna
本探讨抓取HCC肉瘤范例(n=7)的单神经元核RNA测序统计资料集展开具体了解,知道糖酵解催化活性关键分散在肉瘤神经元核中,hdWGCNA具体了解面部识别出9个遗传基因控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的长期存活具体了解决定YBX1为人格独立长期存活概率条件(图1H)。进1步根据IHC、WB实验所和肉瘤进行与相临非肉瘤进行的余地转录组学统计资料集表明YBX1是肝神经元核癌治愈的自身靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为转换HCC人体细胞糖酵解的首要影响
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法激光能量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1综合并带动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合实际并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷硝化作用,而使增强其核转位
进一次监测YBX1的O-GlcNAc糖基化有无影晌其磷过酸,在OGT敲低的HCC細胞中或用OGT缓和剂OSMI-1加工,YBX1蛋清技术关卡偏态较低,YBX1磷过酸偏态才能减少(图4A-C)。IP实验设计阐明,在相当的Flag-YBX1底物技术关卡下,YBX1-WT的磷过酸技术关卡偏态超过YBX1-T57A,阐明磷过酸的上升不仅能仅是这是由于更大的YBX1蛋清表现方法(图4D)。溶合了核和质成分知道了TMG加工的HCC細胞中YBX1核表现方法的增高(图4E-F),进一次知道了YBX1磷过酸的首要缓解因素是AKT(图4G-I)。这知道了认为O-GlcNAc糖基化根据提高网站其磷过酸来加快YBX1蛋清安全稳定义并提高网站核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显有帮助于其进一步推动骤发生的磷酸性反应突显并并能提高网站其核转位
05、YBX1促使PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1催进PKM2转录
06、YBX1 要加强组血清乳碱化呈现级别
科研会发现YBX1敲低有效较低核脂肪酸乳碱化,更是是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解仰制作用剂2-DG的试验断定了糖酵解与组核球蛋白乳碱化的立即相互影响,仰制作用糖酵解可有效较低H3K18la水平方向(图6D)。PKM2过抒发不可逆转转YBX1敲低而致的H3K18la骤降,之外源乳酸治疗不止提升自己H3K18la,还存于YBX1抒发调涨,提示卡存有正面反应(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la能够生物富集于YBX1发动子立即带动其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并会发现P300 调涨是YBX1增加H3K18乳酰化做用的机能(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳过酸修饰语水准
好文章总结ppt
在仅仅学习中有关报道了YBX1在HCC中高形容方法,还有就是与糖酵解密码切重要性。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制语,为了可靠蛋清质并新增其形容方法。某种绘制语还使得会YBX1在T57处的磷硝化作用,使得会其核易位。故而,某种阶段提升了糖酵解重要性表观遗传的转录并激起乳酸的生成。显然,YBX1解锁P300的转录,因此控制组蛋清的乳硝化作用,特别的是H3K18la,H3K18乳硝化作用正方向国家宏观调控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因正反面馈环策略图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗卡路里消化吸收组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻譯后呈现组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
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Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.