在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

学习结论

1、从光敏提升神经元中抽取DNA交连蛋清质

方便溶合光热塑胆固醇质-DNA和好物采用LC-MS剖析，诗人搭建了了种转化纯化细则，可从DNA中去否则热塑胆固醇质，仅在直射时实现单独dna组玩含有DNA热塑胆固醇质。用TRIZOL分离出染色法质并洗去被抓获的非热塑胆固醇，然而将其从新分解以做好RNase化解。实现超声检查切剪得到的胆固醇质热塑DNA的分离出物，在硫氰酸胍中烧沸转化，并在二硫化硅离心分离柱上急剧洗衣以去否则热塑胆固醇质一直到完毕。实现核酸酶正确处理从DNA中脱离光热塑胆固醇，并做好胰胆固醇酶化解采用LC-MS剖析。该方式 被命名为胆固醇质热塑DNA分离出或XDNAX。

图1.核营养素化学交联DNA去除或XDNAX具体步骤图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可可以碰到DNA的蛋白酶质图谱

将光化学交联办法应运于MCF7神经元，遇到了1,805种获选血清，这当中1,191种会有于3个或许多次重覆中。60%的DNA彼此之间功效组带着核酸切合的GO参考文献标注，在较弱核酸切合参考文献标注的血清质中，主要的奉献来源于核纤层血清，另外是通过脱色质结构和神经元分化的血清质（图2）。

图2 . 可之间学习 DNA 的淀粉酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3总结怎么写了DNA之间能力组所蕴涵的核脂肪酸-DNA菜单栏和其收录的核苷酸交连肽。这是指原因（1）球状DNA综合组成部分域、（2）DNA 综合无序性区（IDR）和（3）原因与某些核脂肪酸（这类组核血清酶综合核血清酶）、RNA（这类剪接指数公式）或相分离法区室（这类核仁核血清酶）之间能力而致使的环镜临近。

图3 . 可单独遇到 DNA的构造域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法癌细胞扰动期间里与DNA依照的转录因素

孕缴素类感觉α（ESR1）驻放在胞质溶胶中，知道碰到其配体，打断易位到生殖細胞质，在绿中岛别墅它与dna组中的单一的地域结合在一起以激活卡单一的的转录程序流程。将血清饥饿的MCF7生殖細胞外露于高用药量孕缴素类（10 nM 17β-雌二醇）4两7分钟，与模拟机进行处理的照表生殖細胞对比二者的DNA完美反应组（图4A）。在这当中，孕缴素类热血后DNA完美反应组中的ESR1加入了30倍（图4B）。总的当今社会，在1,814个降钙素原检测的血清质-DNA完美反应中，约有9%屏幕上显示出多于2倍的相关性变动，并观察植物到与ESR1享有完美反应的血清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 性激素药治理 甲状腺癌肿瘤细胞 DNA 共同影响组的按量相比（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人心得体会

探讨到复染体遗传组的淀粉酶质以理解它是要怎样被读取硬盘并付诸实操的，直是教育科研专家管理的长时的执着。复染体遗传组可及性注意以DNA为核心的多角度实现探讨，或许，到近年来就行，复染质妇科凝胶中的有哪些淀粉酶质与DNA 显示物理上的共同功能尚不很清楚。运用零高度光交连，可显示DNA共同功能组中的大都数淀粉酶质，XDNAX技木将算作淀粉酶质-DNA共同功能探讨的雄厚方法。

拜谱个人心得体会

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的核核苷酸组学、体现组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参看文章：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.