
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析最后
研究方案工作人员研究性伴随要在保鲜冷库室保存时候多牛羊肉的强度、持水利、色调、矿酸铁水分水分含量、ROS、脂质过被氮化合物、MDA、GSH和GPX4特性来评估报告肌聚集受损细胞系的铁致死状况。效果凸显,要在保鲜冷库室保存时候多后,牛羊肉的强度在第5天和第6天相关性急剧下降;持水特性降低了;彩色变深,得不到光泽度,鲜红白色转变成暗红白色。除此以外,矿酸铁、化学活化氧和MDA的水分水分含量相关性多,受损细胞系凋亡率相关性增高。 设计者分离出来与众区别保鲜冷库事件的健身脂肪印刷品英文的血清酶质,如果对其进行SDS-PAGE进行介绍,血清酶质条带在与众区别晚清时期分布图制作饱满且似的(图1a)。通过血清酶在与众区别印刷品英文中的形容情况报告,进行介绍挖掘指定组印刷品英文的中数字相近于指定横向(图1b),情况说明健身脂肪印刷品英文血清酶质兼备良好的的组内似的性和组间差女性朋友性。 蛋清质组学共认定出1996种蛋清质。以B0为差表组,筛分B1、B2、B4和B6中的蛋清开始对比深入了解体现出深入了解,共认定到376个DEPs。将火山图web3d,并只能根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个标准化深入了解DEP。效果如图图甲中1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别认定出22、33、73和140个DEPs,其中的别上涨6、11、32和8八个,变动16、22、41和55个。聚类分析具体方法评诂了的不同冷冻时段段肩部肌肤组建中蛋清质的体现出,效果凸显肩部肌肤蛋清体现出对比深入了解不断地补充时段的扩大而扩大(图1g)。
图1| 差异保鲜冷库时期的身体肌肉原材料血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一保鲜冷库时刻的肌肉组织检样之间的关系核蛋白介绍(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死球蛋白肽的PRM定量讲解讲解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG聚集差别把你想表达出来淀粉酶的铁生亡工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT一定量球营养物质组学技术水平工艺贴心服务的,拜谱怪物已研发部门顺利完成并设立了进一步完善成熟完善的转录组学、球球蛋白组学、基础代谢组学或者多个学连合食品技术水平工艺贴心服务的标准体系,欢迎致电咨询!
可以参考论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.